芹菜細菌性軟腐病主要危害葉柄基部。防治方法：
田間管理。芹菜軟腐病主要通過土壤等傳播，重茬地的土壤易積累大量病菌，連茬種植勢必易發病和加重病情，所以應實行兩年以上的輪作。由于芹菜軟腐病菌首先是從植株的傷口處侵入，在定植、中耕、除草等各種操作過程中，應避免傷根或使植株造成傷口。定植不宜過深，培土不應過高，以免葉柄埋入土中。雨后及時排水。發現病株及時清理，并撒入石灰等消毒。發病期減少或停止澆水，防止大水漫灌。
及時防蟲。昆蟲能在植株上造成傷口導致發病，所以應及時防蟲。
清潔田園。田間出現病株后立即拔除，并用藥液及時處理，澆灌病株及其周圍健株，可減輕發病。收獲后及時清理病株殘體，并攜出田外深埋或燒毀，深翻土壤，加速病殘體的腐爛分解。
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